| 一 | 独立行政法人国立公文書館 |
| 二 | 独立行政法人通信総合研究所 |
| 三 | 独立行政法人消防研究所 |
| 四 | 独立行政法人酒類総合研究所 |
| 五 | 独立行政法人国立特殊教育総合研究所 |
| 六 | 独立行政法人国立オリンピック記念青少年総合センター |
| 七 | 独立行政法人国立女性教育会館、 |
| 八 | 独立行政法人国立青年の家 |
| 九 | 独立行政法人国立少年自然の家 |
| 十 | 独立行政法人国立国語研究所 |
| 十一 | 独立行政法人国立科学博物館 |
| 十二 | 独立行政法人物質・材料研究機構 |
| 十三 | 独立行政法人防災科学技術研究所 |
| 削除 | H15政368 H151001（独立行政法人航空宇宙技術研究所） |
| 十五 | 独立行政法人放射線医学総合研究所 |
| 十六 | 独立行政法人国立美術館 |
| 十七 | 独立行政法人国立博物館 |
| 十八 | 独立行政法人文化財研究所 |
| 十九 | 独立行政法人国立健康・栄養研究所 |
| 二十 | 独立行政法人産業安全研究所 |
| 二十一 | 独立行政法人産業医学総合研究所 |
| 二十二 | 独立行政法人農林水産消費技術センター |
| 二十三 | 独立行政法人種苗管理センター |
| 二十四 | 独立行政法人家畜改良センター |
| 二十五 | 独立行政法人肥飼料検査所 |
| 二十六 | 独立行政法人農薬検査所 |
| 二十七 | 独立行政法人農業者大学校 |
| 二十八 | 独立行政法人林木育種センター |
| 二十九 | 独立行政法人さけ・ます資源管理センター |
| 三十 | 独立行政法人水産大学校 |
| 削除 | H15政390 H151001 （独立行政法人農業技術研究機構） |
| 三十二 | 独立行政法人農業生物資源研究所 |
| 三十三 | 独立行政法人農業環境技術研究所 |
| 三十四 | 独立行政法人農業工学研究所 |
| 三十五 | 独立行政法人食品総合研究所 |
| 三十六 | 独立行政法人国際農林水産業研究センター |
| 三十七 | 独立行政法人森林総合研究所 |
| 三十八 削除 | 独立行政法人水産総合研究センター H15政397 H151001 |
| 三十九 | 独立行政法人経済産業研究所 |
| 四十 | 独立行政法人工業所有権総合情報館 |
| 四十一 | 独立行政法人産業技術総合研究所 |
| 四十二 | 独立行政法人製品評価技術基盤機構 |
| 四十三 | 独立行政法人土木研究所 |
| 四十四 | 独立行政法人建築研究所 |
| 四十五 | 独立行政法人交通安全環境研究所 |
| 四十六 | 独立行政法人海上技術安全研究所 |
| 四十七 | 独立行政法人港湾空港技術研究所 |
| 四十八 | 独立行政法人電子航法研究所 |
| 四十九 | 独立行政法人北海道開発土木研究所 |
| 五十 | 独立行政法人海技大学校 |
| 五十一 | 独立行政法人航海訓練所 |
| 五十二 | 独立行政法人海員学校 |
| 五十三 | 独立行政法人航空大学校 |
| 五十四 | 独立行政法人国立環境研究所 |
| 五十五 | 独立行政法人教育研修センター |
| 五十六 | 自動車検査独立行政法人 H13政297 H140701- |
| 五十七 | 独立行政法人統計センター H14政296 H150401- |
| 五十九 | 独立行政法人原子力安全基盤機構 H15政244 H151001- |